Perú es el país pionero en descentralizar la implementación del EITI a nivel sub nacional (regional), lo que ha permitido transparentar los recursos transferidos por el Estado a las instituciones de ámbito sub-nacional y los usos de estos recursos por parte de estas entidades (Gobierno regional, gobiernos locales, entre otros). Los EITI regionales están integrados por representantes de Estado, empresas y sociedad civil, específica de cada región; los cuales fueron creadas y están reguladas por ordenanzas regionales (OR), en donde se estipulan sus funciones, ámbito de trabajo y los integrantes.

Actualmente, se cuenta con 08 Comisiones Regionales EITI instaladas y activas (Piura, Moquegua, Arequipa, Apurímac, Loreto, Ancash, La Libertad y Cajamarca).